Si el propósito del S.O. va a ser una estación de trabajo, le recomiendo que cambie el perfil del sistema. De esta forma muchas configuraciones que usan los entornos gráficos, como por ejemplo, que la variable USE active las X, estarán habilitadas por defecto.
Por el contrario, si el S.O. sólo va llegar a consola y ejecutará servicios como ser servidor http o bases de datos, no active el perfil desktop.
Para hacer el cambio, instale el paquete eselect y elija el perfil desktop:
# emerge eselect # eselect profile list # eselect profile set default-linux/x87/2007.0/desktop # eselect profile show